加州湾区拥有众多著名大学，以下是部分知名学府的列表：
1. 斯坦福大学 （Stanford University）
私立研究型大学，位于旧金山湾区南部的帕罗奥多市。
2. 加州大学伯克利分校 （University of California, Berkeley）
公立研究型大学，位于旧金山湾区伯克利市。
3. 加州理工学院 （California Institute of Technology, Caltech）
私立研究型大学，位于洛杉矶东北郊的帕萨迪纳市。
4. 加州大学洛杉矶分校 （University of California, Los Angeles, UCLA）
公立研究型大学，位于洛杉矶。
5. 加州大学圣地亚哥分校 （University of California, San Diego, UCSD）
公立研究型大学，位于圣地亚哥。
6. 加州大学圣巴巴拉分校 （University of California, Santa Barbara, UCSB）
公立研究型大学，位于圣巴巴拉市。
7. 加州大学戴维斯分校 （University of California, Davis, UCD）
公立研究型大学，位于戴维斯市。
8. 加州大学圣克鲁兹分校 （University of California, Santa Cruz, UCSC）
公立研究型大学，位于圣克鲁兹市。
9. 加州海事学院 （California Maritime Academy）
位于旧金山湾区。
10. 加州州立大学东湾分校 （California State University, East Bay）
位于旧金山湾区。
11. 加州州立大学蒙特利湾分校 （California State University, Monterey Bay）
位于旧金山湾区。
12. 圣荷西州立大学 （San José State University）
公立研究型大学，位于圣荷西市。
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