复旦大学的专业院系包括：
1. 复旦学院
2. 中国语言文学系
3. 外国语言文学学院
4. 历史学系
5. 文物与博物馆学系
6. 旅游学系
7. 哲学学院
8. 国际关系与公共事务学院
9. 新闻学院
10. 经济学院
11. 管理学院
12. 社会发展与公共政策学院
13. 法学院
14. 数学科学学院
15. 物理学系
16. 化学系
17. 高分子科学系
18. 环境科学与工程系
19. 信息科学与工程学院
20. 软件学院
21. 光源与照明工程系
22. 材料科学系
23. 力学与工程科学系
24. 生命科学学院
25. 上海医学院
26. 公共卫生学院
27. 药学院
28. 护理学院
29. 微电子研究所
30. 国际文化交流学院
31. 复旦大学上海视觉艺术学院
32. 大气与海洋科学系
33. 核科学与技术系
34. 临床医学院
35. 基础医学院
36. 药学院
37. 护理学院
38. 工程与应用技术研究院
39. 国家保密学院
40. 航空航天系
41. 大数据学院
42. 计算机科学技术学院
43. 艺术设计系
建议您根据最新的招生简章或学校官方信息，确认是否有院系或专业的变动。