哈尔滨工程大学拥有水下通讯专业，即水声工程专业。该专业是国家重点学科之一，也是国家海洋强国战略中的重点专业。哈尔滨工程大学的水声工程专业源于1953年我国建立的第一个声纳专业，目前已发展成国内规模最大、学科方向最齐全、师资力量最雄厚的水声人才培养基地。
此外，大连理工大学在软件学院和国际信息与软件学院在水下可见光定位和无线感知方向也取得了突破性进展，虽然大连理工大学并没有直接开设水下通讯专业，但其相关研究领域的进展表明该校在这一领域有较强的研究实力。
建议对水下通讯专业感兴趣的学生可以考虑报考哈尔滨工程大学的水声工程专业，以获得更为专业和系统的训练。