东南大学拥有多个优秀的班级，其中包括但不限于以下几个：
吴健雄班
包含专业：信息工程等4年制理工科类所有专业。
特点：生源质量好，师资力量强，资源倾斜，本研一体化，保研率高，重点培养。
工科试验班
包含专业：建筑学、城乡规划、风景园林、信息工程、电子科学与技术、海洋信息工程、计算机科学与技术、人工智能、网络空间安全、软件工程等。
特点：被称为东南大学的四大王牌专业之一。
其他特色班级
钱学森班、 弘毅学堂（工科试验班）、 徐特立班、 英才学院：与吴健雄班类似，都是拔尖人才培养班，旨在培养业界高端引领人才。
能源与环境学院032196班：以节能减排和实践先锋为特色，班级成员表现优异，获得多项奖学金和荣誉。
信息科学与工程学院040202班：以创新创业为特色，班级成员在省级及以上竞赛中表现突出。
电子科学与工程学院060205班：以科技创新为特色，班级成员获得多项荣誉。
交通学院2019级道路桥梁与渡河工程茅以升班：名校深造率达到100%，表现卓越。
顾毓琇理科试验班：
包含专业：数学与应用数学、信息与计算科学、统计学、物理学、应用物理学和工程力学。
特点：旨在培养具有扎实理学基础、良好科技素养和创新实践能力的领军人才。
这些班级通常拥有优秀的师资力量、丰富的教学资源和良好的学习环境，适合成绩优异、学习能力强、有意愿在特定领域深造的学生。