遇到二级建造师证书被中介扣留的情况，可以采取以下策略：
查阅合同条款
仔细阅读您与原雇主签订的劳动合同或其他相关协议，查找是否有关于证书转出方面的明确规定。如果合同中有相关条款，可以依据这些条款与公司进行理性、理智的商谈。
与公司协商
诚恳地与您的前任雇主进行深入的交流，详细解释您将证书转出的原因以及其必要性，全力以赴去赢得他们对您的理解以及在这方面的协助。
寻求法律援助
如果以上努力都无法改变现状，您可以寻求专业律师或相关行业协会的意见，了解您的个人权益是否遭受了不公正的侵害。
向相关部门投诉
您可以向当地的建设部门或相关行业协会投诉，说明情况并提供相关证据，请求他们介入协调。
收集证据
在整个过程中，务必收集所有相关的证据，包括与中介的沟通记录、合同文本、工作证明等，以备后续可能的法律诉讼或投诉所需。
断绝服务关系
如果确定证书和印章确实在中介公司，而中介公司拒绝提供，您可以考虑断绝与中介的服务关系，并尽可能索要证书和印章。
法律途径
如果所有其他方法都无效，您可以考虑通过法律途径解决问题，例如向法院提起诉讼，要求中介返还证书和印章。
建议您先尝试通过协商和沟通解决问题，如果这些方法都不奏效，再考虑采取更进一步的法律行动。在整个过程中，保持冷静和专业，确保自己的权益得到最大程度的保护。