监理工程师合同综合费率是指监理工程师服务费、差旅费、办公费、通讯费、材料费、设备费、保险费、税金等各项费用的总和。具体的费率根据不同的项目和地区而有所差异，通常在招标文件中会明确规定。在实际操作中，监理工程师需要根据实际情况进行预算和调整，确保费用合理、透明、公正。
监理工程师的费用一般分包给了承包商，由承包商来支付。一般而言，监理工程师的费用是基于施工合同中的总造价的一定比例，具体比例根据不同工程会有差别。通常情况下，建筑工程的监理费用一般为合同金额的1%至3%，而市政工程的监理费用一般为合同金额的1.5%至3%。机电工程和装饰工程的监理费用相对还要高一些，一般为合同金额的2.5%至5%。
综合费率是指监理服务合同报价的费率，通常它包括了劳务费、交通费、住宿费、餐费、通讯费、办公费、保险费和税金等工作必备的费用。综合费率的制定不仅需要考虑到监理工程师本身的水平和工作负责程度，还需要考虑到地域、建设工程的规模和难度、市场竞争等因素，所以综合费率的制定非常复杂。有关部门通常会根据当前市场情况和工程建设的实际需要，制订出合理的综合费率标准。在中国，监理工程师综合费率标准的制定参考了欧盟建议的标准，并进行了适当的调整。
监理收费应根据所委托监理工程业务范围、深度和工程性质、规模、难易程度以及工作条件等情况，按照下列方法之一计取：
1. 按照参与监理工作年度平均人数计算：3.5万元/人·年。
2. 按工程造价的比例计取：
监理工程造价在500万元及以下的，不得小于2.5%；
监理工程造价在500万元到1000万元的，收取1.9%至2.5%；
监理工程造价在1000万元到5000万元的，收取1.3%至1.9%；
监理工程造价在5000万元到1亿元的，收取1.1%至1.3%；
监理工程造价在1亿元到5亿元的，收取0.7%至1.1%；
监理工程造价在5亿到10亿元的，收取0.5%至0.7%；
监理工程造价在10亿元以上的，不得大于0.5%。
因此，监理工程师合同综合费率是一个复杂的数值，需要根据具体情况进行计算和确定。在实际操作中，建议监理工程师和业主进行充分沟通，明确费用构成和费率，并在招标文件中明确规定，以确保项目的顺利进行和费用控制。