监理工程师注册时可以选择的专业有以下十四个：
1. 房屋建筑工程
2. 冶炼工程
3. 矿山工程
4. 化工石油工程
5. 水利水电工程
6. 电力工程
7. 农林工程
8. 铁路工程
9. 公路工程
10. 港口与航道工程
11. 航天航空工程
12. 通信工程
13. 市政公用工程
14. 机电安装工程
建议
根据工作需求选择：如果工作单位对监理工程师资格证书的专业有要求或限制，应先了解清楚本单位的要求后再作决定。
根据所从事的工作领域或所学专业选择：选择与自己工作领域或所学专业相关的专业，有助于备考和实际工作。
根据自身兴趣与未来职业规划选择：如果对当前从事的行业不太满意，可以考虑选择更感兴趣的行业。
根据各专业难易程度选择：如果对专业没有特殊要求，可以选择比较好考、市场更大的专业，如土木建筑工程专业。
市场需求
土木建筑工程：市场需求较大，涵盖了房屋建筑工程、电力工程、市政公用工程等多个热门领域。
交通运输工程：包括公路工程和水运工程，市场需求也较大，特别是随着交通基础设施建设的增加。
水利工程：包括水利工程施工监理、水土保持工程施工监理等，市场需求相对较小，但专业程度较高。
其他注意事项
监理工程师考试分为“土木建筑工程”、“交通运输工程”和“水利工程”三个专业类别，报考人员可根据实际工作需要选择其中一个专业类别报考。
取得资格证书后，每人可根据报名专业选择对应专业注册，每人最多可以申请两个专业注册。
综合以上信息，建议选择与自己工作领域或兴趣最为相关的专业，同时考虑市场需求和未来的职业规划，以确保选择的专业既有利于备考又能满足工作需要。