如果一级建造师所在单位不配合注销，可以采取以下措施：
与企业协商
首先，可以尝试与企业进行沟通，说明个人情况并请求注销。如果企业同意，可以按照相关流程进行注销。
向主管部门投诉
如果企业拒绝注销，可以向所在地的建设主管部门投诉，请求协助解决问题。建议提供相关证据和材料，以便主管部门更好地了解情况并进行处理。
寻求法律援助
如果以上方法都无法解决问题，可以寻求法律援助，通过法律途径解决问题。建议咨询专业律师，了解相关法律规定和程序，并根据实际情况进行处理。
申请强制注销
如果企业不配合注销注册，持证人本人可以携带相关材料原件及复印件至窗口申请强制注销。具体所需材料可能包括情况说明、身份证、解聘证明、诚信承诺书等。
联系工商行政管理部门
可以联系当地工商行政管理部门，提供相关证据，申请强制注销。若无效，可考虑法律途径，咨询专业律师。
向劳动仲裁部门或法院申诉
如果与原聘用企业解除劳动关系后，企业仍不予配合办理建造师相关手续，可以提交申请报告和相关解除劳动关系的有效证明材料原件和复印件，到省注册中心注册科进行申诉。
在采取以上措施时，建议咨询专业律师或相关部门，以确保按照法律程序进行操作，维护自身合法权益。