铁路监理工程师的注册确实与建设部有关。根据相关文件和信息，我们可以得出以下结论：
注册机构：
铁路监理工程师的注册是由建设部或其授权的单位进行的。这意味着，无论是铁路监理工程师还是其他行业的监理工程师，其注册都需要通过建设部门或其授权的单位进行。
资质认可：
铁路行业承认建设部颁发的监理工程师证书。持有建设部颁发的监理工程师证书的从业人员可以在铁路监理领域工作。
证书类别：
国家注册监理工程师（国注）包括铁路工程专业，这个证书可以用于铁路监理工作。
考试与注册：
监理工程师需要通过国家统一考试，取得《监理工程师资格证书》，并在建设部进行注册。专业与本人其他专业证件相符，需连续4年内通过四科的考试，合格发证。
综上所述，铁路监理工程师的注册是在建设部进行的，并且持有建设部颁发的监理工程师证书可以在铁路监理领域工作。