选择监理工程师的专业时，可以考虑以下因素：
市场需求
土木建筑工程：目前市场需求量最大，证书含金量也较高。这个专业的监理工程师主要负责工程项目土建监理工作的具体实施，包括编制施工计划、核查进场材料、设备、构配件的质量证明文件及质量情况等。
交通运输工程：市场需求量次之，专业性强，对非相关专业的考生来说难度较大。就业方向包括交通运输管理部门、交通运输企事业单位等，从事交通运输组织、指挥、决策以及企业生产与经营管理等工作。
水利工程：市场需求量相对较小，但专业前景也不错。主要负责水利工程项目的监理工作，需要具备相关的水利工程知识和技能。
个人兴趣和职业规划
选择与个人兴趣和职业规划相符的专业，更容易取得好的成绩和职业发展。例如，如果对建筑领域有浓厚兴趣，那么选择土木建筑工程专业可能更为合适。
考试难度
土木建筑工程：对零基础的考生比较友好，复习难度相对较低。
交通运输工程和水利工程：专业性较强，对非相关专业的考生来说难度较大。
负责部门
土木建筑工程专业由住房和城乡建设部负责；
交通运输工程专业由交通运输部负责；
水利工程专业由水利部负责。
综合以上因素，以下是一些建议：
如果选择土木建筑工程专业，建议注册房屋建筑工程、电力工程、市政公用工程等较为热门的专业，这些专业的就业范围较广。
如果选择交通运输工程专业，可以根据自己的从业领域和经验，选择注册公路工程或水运工程专业类别，具体岗位包括道路与桥梁、隧道工程、公路机电工程等。
如果选择水利工程，虽然市场需求量较小，但具有广阔的发展前景，适合具有相关技术技能和对水利工程领域有深厚兴趣的考生。
最终选择哪个专业，建议考生结合自己的实际情况、兴趣和职业规划，以及市场发展趋势进行综合考虑。