二级建造师在税收制度方面主要涉及以下几方面：
个人所得税
职业技能教育费用抵扣：二级建造师在获取职业技能教育方面支出的费用可以作为个人所得税的专项扣除项目。
个人所得税起征点：个人所得税的起征点为5000元/月，超过此金额部分需要缴纳个人所得税。
专项附加扣除：某些职业资格或专业技术资格可能会被视为个人所得税的扣除项。
增值税
一般纳税人：应纳税额 = 当期销项税额（销售额 * 税率） - 当期进项税额。销项税额小于进项税额不足抵扣时，不足部分可以结转下期继续抵扣。
小规模纳税人：应纳税额 = 销售额 * 征收率（3%）。不得抵扣进项税额。
增值税额抵扣：在承接工程项目时，建筑企业可以将二级建造师的工资和奖金等人工费用在增值税申报中予以扣除，降低企业的增值税负担。
社会保障费用
包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等，具体费率根据各地政策有所不同。二级建造师作为雇员，需要按照国家规定的比例从工资中扣除相应的社会保障费用。
需要注意的是，享受相关税收优惠政策时，必须符合国家的相关规定，申请过程也要遵守程序，否则可能会被认定为偷税漏税行为，承担相应的法律责任。