电气工程师证书的颁发机构主要有以下几种：
工业和信息化部教育与考试中心：
该中心负责中国计算机技术与软件专业技术资格（水平）考试、通信专业技术人员职业水平考试等，并承担电子通信行业职业技能鉴定等工作。电气工程师证书由该中心颁发，是行业和国家认可的，具有正规的信息备案，证书在官网支持查询，含金量高。
人力资源社会保障部和住房城乡建设部：
这两个部门共同颁发《中华人民共和国注册电气工程师资格证书》。该证书在全国范围内有效，注册电气工程师专业考试合格后获得，领取方式包括网上申请快递邮寄和现场领取两种方式。
中国电机工程学会（CSEE）：
该学会是中国电力工程领域的专业学术组织，可以颁发电气工程师证书。
美国电气和电子工程师协会（IEEE）：
IEEE 是全球最大的电气和电子工程师专业协会，可以颁发各种电气工程师证书，如 IEEE 认证的电气工程师（IEEE Certified Electrical Engineer）证书。
英国工程技术学会（IET）：
IET 是英国的工程技术专业组织，可以颁发电气工程师证书，如 IET 注册工程师（IET Registered Engineer）证书。
加拿大工程师协会（Engineers Canada）：
该协会是加拿大的工程师专业组织，可以颁发电气工程师证书，如专业工程师（Professional Engineer）证书。
建议选择工业和信息化部教育与考试中心颁发的证书，因为它是国内官方认可的，具有高含金量，并且证书在官网支持查询。如果考虑国际认可度或特定专业领域的认证，可以考虑其他学会或协会颁发的证书。