二级建造师考试中的三个科目，哪一门相对较难并没有一个统一的答案，因为它 取决于个人的背景和报考专业。然而，根据多个来源的综合信息，可以得出以下结论：
《专业工程管理与实务》
被普遍认为是较难的科目。
案例题综合性较强，考核考生施工现场实际操作经验和专业知识的综合运用水平。
《建设工程施工管理》
知识点繁多，涉及工程项目的组织、进度、质量、安全、合同、信息等多个方面。
需要记忆大量的知识点，并且能够将其应用到实际工作中解决实际问题。
《建设工程法规及相关知识》
法律法规更新快，考生需要随时关注最新的法规变化。
条文多且复杂，理解起来有一定难度。
此外，还有一些专业如建筑工程、市政工程、机电工程、公路工程和矿业工程，这些专业的考试难度也因其专业性和考试内容的专业性而有所不同。例如，建筑工程专业涉及的内容较广，需要考生具备较强的建筑专业知识和实践经验；而市政工程由于考试面广，包括多个板块，复习过程可能较为困难。
建议：
如果考生长期从事施工管理工作，可能会觉得《专业工程管理与实务》、《建设工程施工管理》和《建设工程法规及相关知识》并不特别难。
对于刚参加工作或未从事施工现场管理的人来说，可能会觉得《专业工程管理与实务》较难，而其他两门相对简单。
选择专业时，可以考虑自己的兴趣和实际工作经验，选择相对较为擅长的专业，这样备考和考试都会更加顺利。