企业变更二级建造师的流程如下：
准备相关材料
建造师执业资格证书原件及复印件
建造师执业注册证书原件及复印件
身份证原件及复印件
与原聘用单位解除劳动关系的证明文件（如劳动合同终止单等）
与新聘用单位签订的劳动合同或聘用合同
近期一寸免冠照片若干张
填写完整的《建造师变更注册申请表》
提交变更申请
建造师本人需向新聘用单位所在地的建设行政主管部门提交变更注册申请
具体提交的部门可能因地区而异，一般为企业注册地的市级建设行政主管部门或其指定的注册中心
审核与公示
相关部门在收到变更注册申请后，会对所提交的材料进行审核
审核通过后，会将相关信息进行公示，公示期一般为7至14天
公示期间若无异议，则视为变更注册成功
领取新的执业注册证书
公示无异议后，建造师本人可携带身份证原件到原受理部门领取新的执业注册证书
注意事项：
聘用企业变更无需删除证书信息，无需解聘人员
变更企业名称需要上传变更后的《企业法人营业执照》
变更人员姓名需要上传变更后身份证明复印件或公安户籍管理部门出具的有效证明
变更流程完成后系统自动完成
建议提前了解当地建设行政主管部门的具体要求和流程，以确保变更过程顺利。