注册消防工程师在注册有效期内可以更换工作单位，具体流程如下：
向原注册单位办理注销手续
携带身份证、资格证书、劳动合同等相关材料，到消防部门办理注销手续。
在新单位进行注册
到新单位后，需要提交相关资料进行注册。具体所需材料可能包括新聘用单位的消防技术服务机构资质证书副本复印件、消防安全重点单位证明材料、与新聘用单位签订的劳动合同或聘用文件复印件、社会保险证明或人事证明复印件、与原聘用单位解除（终止）工作关系证明等。
变更注册
在申请变更注册时，需要在消防技术服务机构和注册消防工程师业务信息管理系统中申请，并且需要等待注册审批部门准予其变更注册后才能执业。
注意事项
在申请变更注册期间，注册消防工程师不得执业。
如果原注册有效期届满在半年以内，可以同时提出延续注册申请。
建议：
在进行更换工作单位前，建议先咨询当地消防部门或相关机构，了解详细的办理流程和所需材料，以确保顺利完成变更注册。