千叶大学：
千叶大学在国立大学中是唯一一所拥有独立研究科-园艺学研究科的大学，此研究科中几乎包含了园艺学相关的所有研究课题。学校通过文理融合的方法实施学科的教育和研究，包括食品资源、健康、福利、自然、社会、人文科学等跨学科的广泛视角。
东京农业大学：
东京农业大学虽然没有一个独立的研究科，但在大学院农学研究科中有造园学专攻，涵盖了庭园、公园等园林空间和城市到自然地域的舒适环境的计划、设计思想和技术能力等方面的知识和应用能力。
信州大学：
信州大学综合理工学研究科环境农学专攻环境共生学分野中有教授涉及到景观设计、景观保全（如自然公园或都市公园等文化财产的保护）、造园学等研究。
东京大学：
东京大学园艺学相关专业在工学研究科里面，工学研究科里面有建筑学专攻和都市工学专攻，下面有相关的研究分野，如景观分析和绿地生态学。
东京农工大学：
东京农工大学农学研究院自然保全学专攻中有教授涉及到景观生态学方向的研究。
京都大学：
京都大学农学研究科中的森林科学专攻涉及到森林生态系统的保护和活用。
筑波大学：
筑波大学也有风景园林的专业设置。
这些学校都是在园林专业领域具有较高声誉和学术实力，建议根据自己的兴趣和研究方向选择合适的学校进行申请。