考研自命题科目是指 由报考学校自主命题的考试科目。这些科目通常包括专业课，而不包括公共课如思想政治理论、英语一、英语二、俄语、日语、数学一、数学二、数学三等，这些科目是全国统一命题的。自命题科目的试卷只对报考该学校的考生进行测试，且分数线也由报考院校自主决定。这种考试形式允许各个招生单位根据自己的学科特点和人才培养目标来设计题目，有助于选拔出更适合本校培养方向的学生。
总结来说，考研自命题科目是报考学校为了选拔适合自己学校培养方向的学生而自主命题的考试科目，一般是指专业课，其难度和评分标准由报考学校自行决定。