南药和北药都是国内知名的药学院校，各有其考研的优势和难度。以下是它们之间的一些比较：
北药
考研难度相对较低：北药的试题难度不高，容易拿高分，性价比较高。往年北药一般是国家线以上就能有学上，但近年来竞争有所增加，四百多分的高分考生较多。
招生名额较多：北药作为本校，考研成功率会高很多，尤其是对于一志愿报考北药学硕的同学，政策上也开始保护一志愿。
南药
考研难度较大：南药试题难度较大，拿高分较难，尤其是药学综合中的有机化学部分。如果学硕复试被刷，分数不高的话调剂可能会比较困难。
地理位置优势：南药位于江苏南京，地理位置较好，竞争压力也较大。但认真学了并且学透了，不管报考哪个学校都有可能成功。
建议
如果你追求性价比和相对较低的难度，北药是一个不错的选择。尤其是对于一志愿报考北药学硕的同学，政策上的保护使得录取机会更大。
如果你对南药的专业实力有较高认可，并且愿意面对较大的竞争压力，南药也是一个值得考虑的目标。尤其是南药的药学专业实力与“北药”比肩，且地理位置较为优越。
综合考虑，如果你希望考研难度低一些，且对北药有较高认可度，北药是更好的选择。如果你对南药的专业实力有较高要求，并且愿意付出更多努力去应对竞争，南药也是一个可以考虑的方向。