自动化专业三本考研方向主要包括以下几个方面：
控制科学与工程：
这是自动化专业的核心学科，研究控制的理论、方法、技术及其工程应用。涵盖了从基础的控制系统设计到复杂的自动化系统工程，是连接理论与实践的桥梁。该方向的研究方向包括控制理论与控制工程、检测技术与自动化装置等，未来可以参与到智能交通、智能制造、智慧城市等前沿领域的研发中。
模式识别与智能系统：
这是自动化专业与人工智能交叉的重要方向，涵盖了图像识别、语音识别、自然语言处理等多个领域。该方向要求具备扎实的数学和计算机基础，以及创新思维和解决问题的能力。未来可以在人工智能、大数据等领域找到广阔的就业前景。
电力系统及其自动化：
该方向主要研究电力系统在运行过程中存在的问题及解决方法，学习后可以从事电力系统自动化控制和优化调度等方面的工作。
传感器技术与应用：
该方向学习传感器的物理原理、应用方法及其在各种工程领域中的应用，适合喜欢与电路板打交道的学生。学习后可以熟练掌握传感器的选择、测试、校准等技术，从事无损检测、智能控制、生产管理等多个领域的工作。
机电一体化：
该方向主要是学习机械和电气控制两方面达到一体化的综合技术，学习后可以从事智能机器人、自动化生产线和智能制造设备等方面的开发和研究。
智能交通：
该方向主要涉及交通运输中信息化、智能化技术的应用，包括智能交通系统、车辆自动驾驶技术等。学习后可以从事智能交通系统设计、城市交通规划和管理、交通信号控制系统设计等相关领域的工作。
导航、制导与控制：
该专业突出为国防、航天服务的特色，注重理论与工程实际的结合。毕业生可以在航空航天、军工等领域找到高精端的工作机会。
系统工程：
这是一门综合性的工程技术学科，研究如何从整体出发合理组织、控制和管理各类系统。适合对算法有深入兴趣的学生。
电气工程：
该方向主要研究电力系统的运行和控制，适合对电力系统自动化感兴趣的学生。
测绘工程、软件工程、地图学与地理信息系统、电子与通信工程：
这些硕士专业虽然与自动化专业不完全对口，但也是自动化专业学生可以考虑的考研方向，尤其是如果希望跨领域发展。
建议根据个人兴趣和职业规划，选择最适合自己的考研方向。控制科学与工程和模式识别与智能系统是自动化专业中较为热门和前景较好的方向，可以优先考虑。同时，也可以结合自己的兴趣和长期发展目标，选择其他相关学科进行深入研究。