在GIS考研的学校选择上，可以考虑以下几个因素：
学校的专业实力
武汉大学：GIS实力全国高校第一，尤其在遥感方向非常优秀，考研难度较高，但招生人数较多。
南京大学：偏向遥感方向，虽然不太好考，但复试比较公平。
北京师范大学：偏向计算机制图、测绘，考研难度也较高，但招生人数较多。
南京师范大学：偏向编程和应用开发，相对来说比较好考，但并非985高校。
中国科学院地理空间数据云：注重地理分析，科研方向强烈推荐，但难度适中。
学校的地理位置
北京：如北京大学、北京师范大学，地理位置优势明显，就业和学术资源较好。
南京：如南京大学、南京师范大学，江浙沪一带就业市场较好。
武汉：如武汉大学，3S专业在产学研用方面非常活跃。
西安：如长安大学、西安科技大学，测绘工程领域实力较强。
招生名额和难度
武汉大学、 南京大学、 北京师范大学等985高校招生名额较少，竞争较为激烈。
南京师范大学、 南京信息工程大学等211高校招生名额较多，相对容易考一些。
个人兴趣和职业规划
选择自己感兴趣的方向和学校，有利于提高考研和就业的成功率。
考虑未来的职业规划，选择就业前景较好的学校和专业。
综合以上因素，如果你对遥感方向感兴趣，武汉大学是首选，但竞争激烈；如果你希望相对容易一些，可以考虑南京大学或南京师范大学，尤其是南京师范大学在编程和应用开发方面较为突出。如果你希望在北京发展，北京大学和北京师范大学是很好的选择。