新疆研究生最好专业的排名如下：
新疆大学 优势学科：
马克思主义理论、数学、理论经济学、中国语言文学、化学、计算机科学与技术、化学工程与技术等。
王牌专业：法学、汉语言文学、俄语、新闻学、数学与应用数学、化学、机械工程、电气工程及其自动化、电子信息工程、计算机科学与技术等。
特别推荐：中亚语言学。
石河子大学 优势学科：
化学工程与技术、农业科学、临床医学等。
王牌专业：葡萄与葡萄酒工程、农业水利工程、农业机械化及其自动化、中国少数民族语言文学、科学教育、设施农业科学与工程、种子科学与工程专业。
新疆医科大学 优势学科：
临床医学、口腔医学等。
新疆师范大学
优势学科： 化学、计算机科学与技术、人口学等。 王牌专业
新疆农业大学 优势学科：
农业资源与环境、草业科学、农学等。
其他高校
伊犁师范大学、 新疆艺术学院、 喀什大学等高校也有各自的优势学科和特色专业。
建议
新疆大学和 石河子大学在多个学科上都有很高的排名和影响力，特别是新疆大学的中亚语言学在国际上有显著影响力。
新疆医科大学和 新疆师范大学在临床医学和教育学科方面表现突出。
新疆农业大学在农业科学领域具有明显优势。
考生可以根据自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的专业和院校。建议进一步了解各专业的具体课程设置、师资力量和就业前景，以便做出更明智的选择。