自动化专业考研可以考虑的院校有：
1. 清华大学
2. 哈尔滨工业大学
3. 浙江大学
4. 北京航空航天大学
5. 北京理工大学
6. 东南大学
7. 上海交通大学
8. 华中科技大学
9. 西安交通大学
10. 西北工业大学
11. 华南理工大学
12. 国防科技大学
13. 南京航空航天大学
14. 中南大学
15. 天津大学
16. 大连理工大学
17. 吉林大学
18. 同济大学
19. 湖南大学
20. 重庆大学
选择学校时，可以考虑学校的排名、专业实力、师资力量、科研条件以及实习就业情况等因素。同时，建议根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑以上因素，做出适合自己的选择。