设施农业科学与工程专业考研方向主要包括：
设施农业工程与自动化：
关注农业机械化、自动化、生物环境工程等工程技术研究。
设施农业生态环境保护：
研究农业资源管理、生态、环境科学等。
园艺学：
研究园艺植物的栽培、育种、生理等方面。
植物与微生物互作：
研究植物与微生物之间的相互作用，如植物病理学、植物保护等。
农业资源与环境：
关注农业资源管理、农业生态、环境科学等方面的研究。
农产品加工与贮藏：
研究农产品加工、保鲜、贮藏等方面的技术。
农业经济管理：
关注农业经济、政策、企业管理等方面的研究。
蔬菜学：
研究蔬菜作物的生长发育、遗传规律、种质资源、遗传育种、栽培、病虫害防治等。
果树学：
研究果树栽培新技术、育种新技术、果业发展理论等。
茶学：
研究茶叶的栽培、加工、品质鉴定等。
植物学：
研究植物的形态、分类、生理、生态、分布、发生、遗传、进化等。
农业推广：
面向经济社会产业部门，培养特定职业的专业人才。
选择考研方向时，建议根据个人兴趣和职业规划进行选择。