自考考研的毕业证明书申请流程如下：
确保证书获得
确保自学考试证书和学历证书已经获得。
提交材料申请
准备好自考证书和学历证书的原件和复印件，身份证复印件，至少2张一寸照片。
前往办理地点
前往学信网区域教育服务中心进行办理。
等待审核
提交材料后，等待学信网区域教育服务中心审核。
注意事项
核对相关信息是否准确无误，如有错误及时联系工作人员修正。
遗失或损坏毕业证书
如果自学考试毕业生不慎遗失或损坏毕业证书，可申请办理“毕业证明书”，但一律不再补发毕业证书。
非本人办理
如考生本人无法亲自办理，可委托他人代办，并提供相应的委托书和双方身份证原件及复印件。
研究生招生报名
在研究生招生信息网报名时，填写毕业证编号（如果有），并在学位证一栏填“无”。
报名成功后，生成报名号并截图保存。
申请辅助证明
向自考办申请辅助证明，通常需要加盖公章的成绩单证明。
有些省份支持网上申请并邮寄到家。
现场确认
在研究生报名现场确认时，携带成绩单证明进行审核。
请根据以上步骤操作，并注意各个省份的具体要求和流程可能有所不同，建议提前查询当地教育考试院的官方信息