日本留学生回国需要办理的手续主要包括：
学校相关手续
向学校老师说明要回国，并获取离校手续。
获取修了证明书、毕业证明书等重要文件。
宿舍相关手续
结清所有费用，包括房租、水电费和燃气费。
清理垃圾，避免不法投弃。
市役所相关手续
办理转出登记（【転出届け】）。
如果之前加入了国民健康保险，需要提前解约。
银行账户和手机卡
注销或解约银行账户，特别是信用卡。
解约手机卡，避免产生欠费或留下不良信用记录。
其他手续
退还外国人登录证。
如果打工，申请返税。
解约电话合约（如有）。
兑换车票（如有）。
解约房屋租赁合约，包括水电煤气等。
办理留学回国人员证明
在回国前，到中国驻日本大使馆或领事馆办理，以备将来需要时使用。
学历和签证认证
办理无犯罪记录和学历证明，并进行公证认证。
签证续签或延长
检查签证到期时间，必要时提前延长签证。
再入国许可
如果离开日本一年或以上再返回，需要提前办理再入国许可。
其他注意事项
确保所有手续在回国前办理完毕，避免影响后续安排。
如果选择在日本继续读书或工作，需要更新签证类型和住址变更等手续。
请根据个人情况和实际需要，提前规划并准备相应的手续。