日本留学回国需要准备以下材料和手续：
有效护照：
确保护照在有效期内。
签证页及出入境记录：
提供护照首页（照片页）、签证页及出入境记录的复印件。
学位证书或毕业证书：
提供《学位证书》或《毕业证书》的复印件，或预毕业证明原件。
研究证明或在职证明：
博士后人员需提供博士《学位证书》复印件及在职证明或聘用合同原件及复印件。
学习证明：
非攻读学位的预科生、交换生、旁听生等需提供在学证明或修了证明原件及复印件。
回国单程机票：
提供回国单程机票复印件或行程单。
其他相关证明：
如退学证明或结业证明原件及复印件，以及可能需要的照片（二寸或小二寸照片）。
留学回国人员登记表：
填写完整的留学生登记表。
住宿和保险：
如果之前加入了国民健康保险，需要提前解约。
银行账户和手机卡：
注销或解约在日本开设的银行账户和手机卡。
其他手续：
包括宿舍相关手续、市役所转出登记等。
海外学历认证：
如果将来需要办理海外学历认证，可提前到中国驻日本大使馆办理《留学回国人员证明》。
请注意，以上信息可能随时间变化，建议在回国前咨询相关部门或机构获取最新信息。