晚清时期终止留学生的原因主要有以下几点：
封建思想与顽固派的反对：
晚清时期，封建思想根深蒂固，顽固派认为派遣留学生是违背“祖宗成法”的行为，有“用夷变夏”之嫌，因此百般抵制。
留学生思想与朝廷不同：
由于留学生在国外学习，接触到了不同的思想和文化，这使得他们的思想与朝廷的保守观念产生冲突，最终导致留学生运动被迫停止。
政治与文化冲突：
部分留学生在国外接受了现代社会的观念，这与清廷追求传统儒家思想的初衷相悖。例如，吴嘉善赴美国监督留学生时，与曾支持留学计划的李鸿章产生冲突，提议将留学生全部撤回。
培养忠于清廷的人才困难：
清廷希望留学生能够忠于清廷和皇族，但幼童在异国他乡生活多年，很难完全按照清廷的期望培养出符合要求的人才。
综上所述，晚清时期终止留学生的主要原因是封建思想与顽固派的强烈反对，以及留学生在思想和文化上的冲突，使得清廷认为留学计划无法达到预期的效果。