日本留学大学的学历认证在回国后具有以下作用：
证明学位效力：
学历认证可以证明留学生在日本取得的学位与国内学位具有同等效力。
就业：
在求职时，特别是进入国企、事业单位、教育机构、银行、大型外企或报考公务员等情况下，学历认证是必不可少的材料。
落户：
满足一定条件后，留学生可使用学历认证来办理落户手续。
享受政策：
持有学历认证可以享受到国家对留学生的一些优待政策。
升学：
如需在国内继续升学，如从国外硕士回国内读博士，学历认证是必要的。
职称评定：
在国内单位评职称或办理其他证件时，学历认证也是必需的。
其他资格考试：
部分职业资格证书的报考也可能需要提供学历认证。
需要注意的是，学历认证的有效性取决于所就读大学学历学位是否被国内教育部认可。因此，建议在日本留学结束后，及时到留学服务中心进行认证，以确保回国后的学历得到广泛认可