部队办理保留学籍的流程通常包括以下几个步骤：
准备材料
高校录取通知书
身份证（户口簿）
高中毕业证（对于高校新生）
学历证书（对于在校生）
《保留入学资格申请表》
领取并填写申请表
到应征地县级人民政府征兵办公室领取《应征入伍普通高等学校录取新生保留入学资格申请表》。
填写申请表，并如实填写相关信息。
提交申请
将填写好的申请表和入伍通知书复印件提交给征兵办公室。
征兵办公室对申请表进行盖章确认。
学校审核
征兵办公室将加盖公章的申请表和入伍通知书复印件寄送至相关高校招生部门。
高校审核录取资格，并出具《保留入学资格通知书》。
办理入学手续
退役后，持《保留入学资格通知书》和高校录取通知书，到录取高校办理入学手续。
根据政策，退役后两年内允许复学或入学。
请注意，具体流程可能因地区或学校而异，建议联系当地征兵办公室或学校相关部门获取最新信息。