耶鲁大学共设有 15个学院，其院系设置如下：
耶鲁学院：
这是耶鲁大学的本科生院，为学生提供广泛的本科课程和专业选择，注重培养学生的基础知识和综合素养。
人文与科学研究生院：
涵盖众多人文科学和自然科学领域的研究项目和课程，为学生提供深入学术研究的机会。
专业性学院：
包括以下学院
法学院
医学院
商学院
神学院
艺术学院
建筑学院
护理学院
林业与环境学院。
此外，耶鲁大学还设有其他学院，具体如下：
戏剧学院：
授戏剧硕士及博士学位，多年在全美戏剧学院位列榜首。
工程与应用科学院 。森林与环境研究院：
教授森林学硕士、森林科学硕士、环境研究硕士以及森林学博士学位。
管理学院：
授企业管理硕士职业学位，同时也开设机构行为和管理科学方面的博士学位课程。
音乐学院：
授音乐硕士、音乐艺术硕士以及音乐艺术博士学位。
公共卫生学院。
耶鲁文理学院：
这是研究生院，成立于1847年。
这些学院和专业领域共同构成了耶鲁大学全面的教育和研究体系，为学生提供了丰富的学术和职业发展机会。