江苏海洋大学设有多个学院，以下是部分学院的介绍：
海洋技术与测绘学院
简介：海洋技术与测绘学院的前身是1958年的锦屏磷矿技术学校矿山地质测量组。1980年，学校改建为连云港化学矿业专科学校，设置工程测量教研室，1986年，开设工程测量专业（专科）并面向全国招生。1992年，学校更名为连云港化工高等专科学校。2002年，连云港化工高等专科学校并入淮海工学院，空间信息科学系成立，先后更名为测绘工程学院、测绘与海洋信息学院。2004年招收地理信息系统、海洋技术2个专业本科学生，2012年招收海洋资源开发技术专业本科学生。2014年招收海洋科学（物理海洋学）学术型硕士研究生，2015年招收测绘工程专业学位硕士研究生。2019年，学校更名为江苏海洋大学，学院更名为海洋技术与测绘学院，开启了向海发展的新征程。
地址：江苏省连云港市海州区苍梧路59号。
海洋工程学院
简介：海洋工程学院是学校最具特色的年轻学院。2020年7月，为优化海洋学科布局、强化海洋特色，学校整合相关学院的船舶与海洋工程专业和海洋资源开发技术专业组建海洋工程学院。学院承担着学校建设一流海洋特色学科，服务海洋强国、海洋强省战略的重大历史使命。学院现有船舶与海洋工程系和海洋资源开发系，开设船舶与海洋工程和海洋资源开发技术两个本科专业，拥有海洋工程领域土木水利专业硕士学位授权点。船舶与海洋工程专业是国家级一流本科专业、江苏省品牌专业建设专业。
食品科学与工程学院
简介：2003年与海洋与水产学院组成海洋学院（食品工程学院），实行两块牌子，一套班子，协调发展，2016年更名为海洋生命与水产学院（食品科学与工程学院）。2019年6月，学校成功更名为江苏海洋大学，根据学校新的办学定位、总体战略和发展要求，按照学科重组、结构优化、重点突破、协调发展的原则，2020年3月食品科学与工程学院独立设置，2023年4月更名为海洋食品与生物工程学院。
海洋科学与水产学院
简介：海洋科学与水产学院开设海洋资源与环境、海洋科学、生物技术、水产养殖学等专业。
机械工程学院
简介：机械工程学院开设机械设计制造及其自动化、机械电子工程、机器人工程等专业。
土木与港海工程学院
简介：土木与港海工程学院开设土木工程、建筑学、港口航道与海岸工程、工程管理等专业。
电子工程学院
简介：电子工程学院开设电子信息工程、海洋信息工程、通信工程、自动化、电气工程及其自动化等专业，拥有5个硕士专业。
环境与化学工程学院
简介：环境与化学工程学院开设环境工程、化学工程与工艺、高分子材料与工程、安全工程等专业。
计算机工程学院
简介：计算机工程学院开设计算机科学与技术、计算机科学与技术（嵌入式培养）、软件工程（嵌入式培养）、数据科学与大数据技术、网络工程等专业。
药学院
简介：药学院开设制药工程、药物制剂、药物分析等专业。
理学院
简介：理学院开设信息与计算科学、信息与计算科学（嵌入式培养）、光电信息科学与工程、新能源科学与工程、数学与应用数学等专业。
商学院
简介：商学院开设金融学、国际经济与贸易、工商管理、会计学、财务管理、物流管理等专业。
文法学院
简介：文法学院开设汉语言文学、新闻学、法学、行政管理等专业。
外国语学院
简介：外国语学院开设英语、日语、朝鲜语、俄语等专业。
艺术设计学院
简介：艺术设计学院开设视觉传达设计、环境设计、产品设计、数字媒体艺术等专业。
体育学院
简介：体育学院开设休闲体育等专业。
马克思主义学院
简介：马克思主义学院负责马克思主义相关课程的教学和研究。
应用技术学院
简介：应用技术学院主要培养应用型人才。