南京航空航天大学自动化学院的本科专业目录包括：
自动化
自动控制原理
控制系统工程
模式识别与智能系统
自适应控制等学科内容。
测控技术与仪器
涉及电子测量技术
信号处理技术
计算机控制技术
光电技术
大型测控系统设计等方面的学科内容。
机械电子工程
研究机电系统的设计、制造、控制和优化
自动化技术在机械领域的应用
包括机床设计、数字控制技术、传感器技术、电机及其控制技术、运动控制技术等。
智能科学与技术
关注人工智能、模式识别等前沿技术领域
研究智能科学与技术的发展趋势与应用前景。
电气工程及其自动化
包括电机、电力系统、自动控制等方面的课程。
机械工程及自动化
包括机械设计、制造、自动控制等方面的课程。
计算机科学与技术
在智能控制、机器人等方面与自动控制有交集。
这些专业都涉及到自动控制的不同方面，可以根据个人兴趣和职业规划选择适合的方向。