本科专业层次分类是指高等教育中本科教育的专业设置及其分类体系。根据提供的信息，本科专业层次分类主要包括以下几个方面：
学科门类：
这是对学科的归类，通常分为哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等12个基本类别，以及新增的交叉学科和单列的军事学科。
专业类：
在学科门类的基础上，根据知识体系的侧重点不同而进一步细分的类别。本科专业类共有93个。
专业：
这是高校根据社会分工的需要，为培养各类人才而设立的学业类别。本科专业目录中列出的专业数量有792种，分为基本专业、特设专业和国家控制布点专业。
学历层次：
高等教育分为博士、硕士、学士（本科）和专科四个层次。本科专业是学士层次的教育。
培养目标分类：
本科专业还可以根据培养目标分为理论研究型、应用型和实践型专业。
自考专业层次：
高等教育自学考试中，有专科和本科两个学历层次，以及独立本科段作为专业类型之一。
通过这样的分类体系，可以清晰地了解本科专业设置的结构和各个专业的特点，以及它们在社会和学术领域中的作用。