药学本科专业认证标准主要包括以下几个方面：
专业设置
专业目标与要求
专业设置的依据和论证充分
专业设置适应国家、地区、行业经济建设、社会文化发展及医药科技进步的需要
专业设置优势明显、特色鲜明
学生质量
学生自主学习能力、判断性思维能力、信息处理能力
教学质量
课程体系
师资队伍
支持条件（包括教学经费、教学设施、图书资料等）
实践教学
毕业实习与毕业论文
招生与学生发展
招生情况
学生就业情况
学生指导与支持
管理制度与质量控制
教学管理制度
教学质量控制
认证结论分为“通过认证，有效期 6 年”，“通过认证，有效期 3 年”和“不通过认证”三个等级。评价标准基于各个一级指标中的评价意见，分为 A、B、C 三个等级，其中 A 表示“完全达标”，B 表示“基本达标”，C 表示“不达标”。
这些标准旨在确保药学本科专业教育达到一定的教学质量，满足社会和行业对药学人才的需求。