南京大学拥有众多本科专业，以下是一些例子：
汉语言
戏剧影视艺术
历史
文物考古
物理学
天文学
地球科学
地质工程
气象学
地理信息科学
海岸海洋科学
电子信息
通信工程
光学工程
能源科学与工程
临床医学
基础医学
口腔医学
软件工程
信息系统工程
计算机科学与技术
管理科学与工程
控制工程
建筑学
城乡规划
经济学
国际经济与贸易
历史学
数学与应用数学
化学
环境科学
软件工程
临床医学
行政管理
法语
生物科学
物理学
大气科学
哲学
汉语言文学
英语
水文与水资源工程
新闻学
环境科学（环境规划与管理方向）
环境科学（环境化学与环境生物方向）
地质学
地质学（古生物方向）
地质学（地球物理方向）
请注意，专业设置可能会随时间变动，建议以南京大学最新公布的数据为准