本科专业分层是指根据学科知识的深度、广度及应用能力的不同，将本科专业划分为不同的层级。这种划分有助于明确学习者的学习和发展目标，也有助于组织进行人力资源管理和职业发展规划。本科专业通常分为三个层级：
学科门类：
这是对学科的归类，包括哲学、经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等12个类别，以及新增的交叉学科和单列的军事学科。
专业类：
在同一知识体系下，根据知识面侧重的不同而分解出来的类别。本科专业类共93个，例如土木类、电气类、机械类等。同一专业类下的专业在课程设置、学习对象、学习方法等方面具有一定的趋同性。
专业：
高校根据社会分工的需要，培养各类人才设立的学业类别。专业目录中所列出的本科专业数量有792种，分为基本专业、特设专业和国家控制布点专业。基本专业一般是指学科基础比较成熟、社会需求相对稳定、布点数量相对较多、继承性较好的专业。特设专业是满足经济社会发展特殊需求所设置的专业，在专业代码后加“T”表示。2012年及以后新增列入目录的专业均列为特设专业。
这种分层结构有助于更好地组织和理解本科专业，明确不同专业的培养目标和社会需求，以及为学习者提供更为清晰的学习路径和发展方向。